Nous sommes en 2094, 5 ans après la Guerre Finale qui a ravagé le monde pendant 50 ans.

L'île d'Orca, jadis un simple village de pêcheurs, a connu un essor économique considérable avec l'arrivée à la fin du 20ème siècle d'Amalgamated Corporation (AC) qui a aidé l'île à se développer rapidement avec la création de plusieurs villes.

L'île d'Orca a été relativement épargnée par la guerre : les tornades fréquentes qui secouent l'île ont empêché que ne soient envoyés des bombardiers, ce qui fait que l'île a été épargnée par les frappes nucléaires. C'est aussi pour cette raison que de nombreux réfugiés ont afflué d'un peu partout vers la fin de la guerre. 

Pour faire face à la crise qui s'annonçait, AC a créé une force armée (baptisée Garde Civile) pour épauler les forces de police et construit un centre de réfugiés. Cependant, des tensions ont vite surgi. Certains réfugiés protestaient contre les conditions d'accueil et le comportement de la Garde Civile. Des rumeurs circulaient à propos de la disparition soudaine de réfugiés.

C'est lorsque les premiers mutants sont apparus que la révolte a éclaté. Un groupe de réfugiés a mis la main sur une réserve d'armes de la Garde Civile et s'est retranché au dernier étage de l'hôtel d'Hayward Valley, pour fonder la Résistance.
Ils ont cherché à convaincre les réfugiés de se méfier d'AC et de la Garde Civile, selon eux responsables des mutations.

Les affrontements entre factions et avec les mutants ont rapidement eu raison de la quasi totalité de la population, à l'exception de quelques survivants qui ont su se cacher ou fortifier leur habitation.